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分辨率與柱長的平方根成正比。在其他（tā）條件不變的情況下（xià） , 為取得加（jiā）倍的分辨率需有 4 倍的柱長。較短的柱子適於較簡單（dān）的樣品 , 尤其是由那些在結構、極性和揮發性上相差較大的組分組成的（de）樣品（pǐn）。一般來說，
15m 的（de）短柱（zhù）用於快速分離較簡單的樣品，也（yě）適於掃描分析；
30m 的色（sè）譜柱是（shì）最常用的柱長，大多數分析在此長度的柱子上完成；
50m 、 60m 或更長的色譜柱用於分離比較複雜的樣品。
應該注意，柱長增加分析時間也增加。
柱內徑的（de）選擇
柱徑直接影響柱子的效率、保留特性和樣品容量。小口徑柱比大口徑柱有更高柱效，但柱容量更小。
0.25mm ：具有（yǒu）較高的柱效，柱容量較低。分離複雜樣品較好。
0.32mm ：柱效稍低於 0.25mm 的（de）色譜柱，但柱容量（liàng）約高（gāo） 60% 。
0.53mm ：具有類似於填充柱的（de）柱容（róng）量，可用於分（fèn）流進樣，也可用於不分流進樣，當柱容量是主要考慮因素時（如痕量分析），選擇大口徑毛細管柱較為合適。
液膜厚度的選擇
液膜厚度影響柱子的保留特性和柱容量。厚度（dù）增加，保留也增加。
0.1 ～ 0.2m ：薄液膜厚（hòu）度的毛細管柱比厚液膜（mó）的毛細管柱洗脫（tuō）組分快，所需柱（zhù）溫度低，且高溫下柱流失（shī）較小，適用（yòng）高沸（fèi）點的化合物的分析。
0.25 ～ 0.5m ：常（cháng）用的液膜（mó）厚度。
厚（hòu）液膜：對分析低（dī）沸點的化合物較為有利。
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